学校法人・加計学園による獣医学部新設に関して、2017年6月20日(火)、松野博一文部科学相が閣議後に記者会見を行い、萩生田光一官房副長官の新たな発言が掲載された文書を発表した。文書のタイトルは、「10/21萩生田副長官ご発言概要」。この文書には、「和泉補佐官からは、農水省は了解しているのに、文科省だけが怖じ気づいている、何が問題なのか整理してよく話を聞いてほしい、と言われた。官邸は絶対やると言っている」などと記載されている。
同日14時から、民進党 国会対策委員会による「加計学園疑惑調査チーム会合」が開催され、民進党「加計学園疑惑調査チーム」は、この文書に関して、文部科学省と内閣府からヒアリングを行なった。文部科学省はこの文書に関して、「萩生田副長官の発言でない内容が多く含まれており、正確性を欠く」などと説明した。
萩生田副長官は、加計学園の獣医学部新設に関して自ら関与していない、と主張しているが、その発言を援護した形である。